System jest wbrew pozorom bardzo rozbudowany a jego zaawansowana konfiguracja może stanowić pewien problem dla osób bez większego doświadczenia. Złożoność niektórych opcji konfiguracyjnych, chociaż daje dużą elastyczność, może sprawić trudności w dostosowaniu systemu do bardziej specyficznych potrzeb biznesowych. Co za tym idzie, aby w pełni wykorzystać potencjał systemu, użytkownicy muszą poświęcić sporo czasu na dostosowanie programu do swoich potrzeb. Również interfejs programu, choć funkcjonalny, nie jest zbyt intuicyjny, co może sprawić trudności nowym użytkownikom, którzy dopiero zaczynają pracę z systemem. Bezpośredni kontakt z producentem oprogramowania daje możliwość wprowadzania indywidualnych modyfikacji.

System umożliwia importowanie i eksportowanie danych do i z plików Excel, co pozwala na łatwiejsze zarządzanie dużą ilością danych oraz pozwala na wykonywanie analiz w zewnętrznym narzędziu. Gonet CRM umożliwia segmentację bazy danych klientów, jednak proces ten nie jest zawsze w pełni elastyczny. W przypadku bardzo dużych baz danych lub specyficznych wymagań dotyczących segmentacji, system może wymagać ręcznego dostosowania, co może być czasochłonne i uciążliwe. Standardowe raporty, nie zawsze oferują wystarczającą głębokość i elastyczność w porównaniu do bardziej zaawansowanych systemów analitycznych dostępnych na rynku.

System Gonet CRM posiada funkcję integracji z mapami, co umożliwia użytkownikom wygodne zarządzanie danymi geolokalizacyjnymi.

Z perspektywy bezpieczeństwa danych, Gonet CRM spełnia podstawowe normy, ale nie oferuje tak zaawansowanych mechanizmów ochrony, jak niektóre bardziej wyspecjalizowane systemy CRM.

System posiada aplikację mobilną dostępną dla urządzeń opartych na Android. System nie działa na iOS. Aplikacja mobilna nie jest tak funkcjonalna jak wersja desktopowa, co może stanowić problem w przypadku pracy z bardziej skomplikowanymi danymi lub raportami.

W Gonet CRM możliwe jest również zarządzanie danymi klientów, tworzenie ofert oraz korzystanie z własnych szablonów, co pozwala na spersonalizowanie pracy z klientami. System obsługuje także plany i prowizje, co jest przydatne w firmach, które stosują systemy wynagrodzeń uzależnione od wyników sprzedaży. Dodatkowo, Gonet CRM współpracuje z GUS, co umożliwia łatwiejsze pozyskiwanie danych na temat firm i osób prowadzących działalność gospodarczą w Polsce.

Jednym z głównych atutów programu jest jego elastyczność – oferuje dodatkowe moduły, takie jak Serwis i Projekty, co pozwala dostosować system do różnych branż i potrzeb klientów. Wyróżnia się też integracją z centralą Slican – rozwiązaniem popularnym na polskim rynku.

Ostatecznie, Gonet CRM jest systemem, który sprawdza się w wielu polskich firmach, oferując szeroki wachlarz funkcji w atrakcyjnej cenie, ale nie jest wolny od wad. Użytkownicy oczekujący większej szczegółowości analizy danych, zaawansowanych opcji integracji oraz pełnej personalizacji mogą poczuć się ograniczeni przez pewne braki w funkcjonalności systemu. Ponadto, Gonet CRM nie zawsze zaspokaja potrzeby dużych firm o bardziej skomplikowanych procesach biznesowych.